Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms