Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CRABP1P29762 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms