Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2E1P29083 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms