Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HLA-DMAP28067 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms