Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms