Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HRCP23327 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HRCP23327 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
HRCP23327 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
HRCP23327 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
HRCP23327 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
HRCP23327 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HRCP23327 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
HRCP23327 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HRCP23327 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HRCP23327 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HRCP23327 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HRCP23327 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
HRCP23327 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HRCP23327 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HRCP23327 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HRCP23327 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HRCP23327 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HRCP23327 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HRCP23327 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HRCP23327 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HRCP23327 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HRCP23327 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HRCP23327 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HRCP23327 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HRCP23327 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HRCP23327 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HRCP23327 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HRCP23327 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HRCP23327 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HRCP23327 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HRCP23327 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HRCP23327 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HRCP23327 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HRCP23327 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms