Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHA1P21709 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms