Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms