Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMY2BP19961 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms