Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms