Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF1P18846 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF1P18846 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms