Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms