Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms