Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NGFRP08138 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NGFRP08138 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NGFRP08138 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NGFRP08138 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NGFRP08138 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NGFRP08138 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NGFRP08138 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NGFRP08138 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NGFRP08138 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NGFRP08138 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NGFRP08138 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NGFRP08138 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NGFRP08138 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NGFRP08138 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NGFRP08138 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NGFRP08138 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NGFRP08138 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NGFRP08138 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NGFRP08138 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NGFRP08138 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NGFRP08138 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NGFRP08138 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NGFRP08138 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NGFRP08138 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NGFRP08138 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms