Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGAVP06756 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms