Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD3O95983 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MBD3O95983 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MBD3O95983 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MBD3O95983 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MBD3O95983 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MBD3O95983 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MBD3O95983 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MBD3O95983 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MBD3O95983 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MBD3O95983 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MBD3O95983 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MBD3O95983 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MBD3O95983 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD3O95983 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD3O95983 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD3O95983 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD3O95983 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD3O95983 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD3O95983 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD3O95983 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD3O95983 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD3O95983 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD3O95983 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD3O95983 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD3O95983 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD3O95983 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD3O95983 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD3O95983 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD3O95983 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD3O95983 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD3O95983 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD3O95983 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD3O95983 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD3O95983 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD3O95983 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD3O95983 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD3O95983 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD3O95983 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD3O95983 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD3O95983 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD3O95983 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD3O95983 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms