Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TSPAN13O95857 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms