Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX58O95786 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
DDX58O95786 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
DDX58O95786 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX58O95786 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX58O95786 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX58O95786 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX58O95786 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX58O95786 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX58O95786 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX58O95786 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX58O95786 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX58O95786 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX58O95786 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX58O95786 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX58O95786 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX58O95786 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX58O95786 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX58O95786 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX58O95786 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX58O95786 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX58O95786 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX58O95786 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX58O95786 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX58O95786 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX58O95786 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX58O95786 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX58O95786 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX58O95786 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX58O95786 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX58O95786 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX58O95786 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX58O95786 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX58O95786 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms