Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms