Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3JO75822 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3JO75822 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms