Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms