Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTIFO43310 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTIFO43310 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CTIFO43310 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTIFO43310 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTIFO43310 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTIFO43310 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTIFO43310 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTIFO43310 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTIFO43310 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTIFO43310 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTIFO43310 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTIFO43310 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CTIFO43310 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTIFO43310 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTIFO43310 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTIFO43310 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CTIFO43310 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTIFO43310 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTIFO43310 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTIFO43310 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTIFO43310 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CTIFO43310 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTIFO43310 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CTIFO43310 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CTIFO43310 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CTIFO43310 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CTIFO43310 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CTIFO43310 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTIFO43310 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTIFO43310 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTIFO43310 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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