Protein–RNA interactions for Protein: O15259

NPHP1, Nephrocystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1O15259 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP1O15259 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP1O15259 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP1O15259 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP1O15259 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP1O15259 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NPHP1O15259 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NPHP1O15259 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NPHP1O15259 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NPHP1O15259 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NPHP1O15259 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms