Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAF5O00463 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms