Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3FO00303 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms