Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1D1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1D1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C1D1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C1D1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C1D1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C1D1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C1D1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C1D1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C1D1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C1D1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C1D1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C1D1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C1D1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C1D1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C1D1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C1D1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C1D1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C1D1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C1D1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C1D1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H7C1D1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H7C1D1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H7C1D1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H7C1D1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H7C1D1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C1D1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C1D1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C1D1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C1D1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C1D1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C1D1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C1D1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C1D1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C1D1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C1D1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C1D1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C1D1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C1D1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C1D1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C1D1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C1D1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms