Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPBD1B2RD01 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms