Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms