Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX3A6NHT5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms