Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23AA6NH52 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms