Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms