Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms