Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms