Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms