Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF804BA4D1E1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms