Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIPSLA2A3N6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms