Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y664

KPTN, KICSTOR complex protein kaptin, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPTNQ9Y664 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPTNQ9Y664 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPTNQ9Y664 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPTNQ9Y664 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPTNQ9Y664 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPTNQ9Y664 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KPTNQ9Y664 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPTNQ9Y664 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPTNQ9Y664 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KPTNQ9Y664 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KPTNQ9Y664 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPTNQ9Y664 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPTNQ9Y664 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPTNQ9Y664 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPTNQ9Y664 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPTNQ9Y664 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPTNQ9Y664 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPTNQ9Y664 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPTNQ9Y664 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPTNQ9Y664 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPTNQ9Y664 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KPTNQ9Y664 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms