Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms