Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP20Q9Y2K6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms