Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RCE1Q9Y256 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms