Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms