Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP1Q9UPQ3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms