Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FZD4Q9ULV1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms