Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC9Q9UKV0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms