Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms