Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms