Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APEX2Q9UBZ4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms