Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms