Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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TMOD3Q9NYL9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24■■□□□ 1.43
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TMOD3Q9NYL9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
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TMOD3Q9NYL9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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TMOD3Q9NYL9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
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TMOD3Q9NYL9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMOD3Q9NYL9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
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