Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM53CQ9NYF3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms